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单细胞RNA测序揭示腹主动脉瘤的细胞亚群

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本研究通过单细胞测序确定单个细胞水平上的转录结果,研究发现,与对照组主动脉相比,弹性蛋白酶诱导的AAA表现为平滑肌细胞数量减少,免疫细胞增加。平滑肌细胞的亚群分析在对照组和AAA样本中都发现了四个亚群。一个特定的亚簇在应用弹性蛋白酶14天后明显增加,这被认为是AAAs的进展的提示。然后通过对平滑肌细胞亚群进行特定的基因特征分析。研究者发现,AAAs平滑肌细胞中的收缩基因,如Myh11和Tagln减少,而几个细胞因子的mRNA则增加,包括Cxcl2和Ccl2。在发病14天后,平滑肌细胞亚群中Thbs1和Notch3的含量很高,其在AAA的形成中发挥了关键作用,而且值得注意的是,白细胞介素10在这个独特的集群中含量很高。这些结果与AAA组织中平滑肌细胞和巨噬细胞的表型转换一致,以上结果为AAA形成的细胞特异性机制提供了新的见解。

——摘自文章章节

组稿人述评

腹主动脉瘤(AAAs)对公众健康具有严重威胁尤其是在老龄化加重的社会中,然而目前还没有任何有效的药物治疗方法来抑制该疾病的进展。因此,医学上迫切需要确定AAA的分子机制,以促进新型药理学方法的开发。近来研究表明,AAA组织包含许多不同的细胞类型,这些细胞可能有多个主要类别的亚型。与Bulk-RNA测序相比,单细胞RNA测序(scRNAseq)是一种非常有潜力的技术,其可以确定细胞水平的转录组基因谱;通过scRNAseq进行全面和无偏倚的基因分析,可以更好地了解生理和病理生理条件下的细胞特定分子特征。自年左右报道scRNAseq技术以来,该技术的使用已急剧增加,改进的scRNA数据分析工具,包括各种分析包程序,极大地促进了scRNAseq的应用。由于scRNAseq是在单细胞水平上进行剖析,因此在这个水平上确定基因丰度是scRNAseq的一大优势。然而scRNAseq测序的一个主要的缺陷是缺乏组织内细胞信息的空间分布。细胞和其组织之间的位置关系对理解疾病过程非常重要。因此,经典的方法,如免疫染色和原位杂交,仍然是阐明空间分布的重要手段。

研究目的

动脉瘤的血管壁中含多种细胞类型,这些细胞的差异化表达导致了多种血管疾病。然而,在腹主动脉瘤(AAA)发病过程中,这些细胞亚群的异质性和差异表达反应还没有得到很好的研究。

方法和结果

对C57BL/6J小鼠的肾下腹主动脉(IAAs)进行假手术处理或腹主动脉周围弹性蛋白酶诱导处理,于术后第7天和第14天对实施干预后的AAA取材进行了单细胞RNA测序。对超过个主动脉血管壁细胞的转录谱进行无偏聚类分析,确定了代表9个细胞系的17个聚类,包括血管平滑肌细胞(VSMCs)、成纤维细胞、内皮细胞、免疫细胞(巨噬细胞、T细胞、B细胞和树突状细胞)以及两类稀有细胞,包括神经细胞和红细胞。Seurat聚类分析确定了四个平滑肌细胞(SMC)亚群和五个单核细胞/巨噬细胞亚群,且具有不同的转录特征。在AAA进展过程中,三个主要的SMC亚群按比例减少,而小亚群则增加,同时伴随着SMC收缩性标志物的下调和促炎症基因的上调。另一个与AAA相关的细胞反应是免疫细胞扩张,特别是单核细胞/巨噬细胞。弹性蛋白酶暴露诱发了主动脉固有的巨噬细胞、血液来源的单核细胞和炎症性巨噬细胞的显著扩张和激活。本研究还发现表达抗炎细胞因子的血源性修复性巨噬细胞增加,表明在AAA进展过程中,炎症的解决和血管的修复也持续存在。

研究结论

本研究确定了AAA疾病相关的IAA中血管细胞的转录特征。此外,在AAA进展过程中VSMCs和单核细胞/巨噬细胞的异质性和细胞反应,这对以上细胞的功能和AAA发病和进展的调控作用提供了另一个视角的见解。预览时标签不可点收录于合集#个上一篇下一篇

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